Anime ini berlatar pada tahun 2039, di mana sebagian besar daratan di Bumi telah tenggelam yang disebabkan oleh global warming. Saat umat manusia hidup dengan mengandalkan lautan sebagai teritori utama, muncul lah ‘Fleet of Fog’ – sebuah pasukan angkatan laut yang tidak diketahui asal, identitas, maupun tujuan sebenarnya. Fleet of Fog memiliki kekuatan tempur yang jauh melebihi kemampuan tempur umat manusia dan memaksa manusia mundur ke daratan.